秦统一后称邾邑，属南郡。后增设衡山郡，为衡山郡郡城。秦亡后，项羽封吴芮为衡山王，立衡山国，以邾城为都。不久，项羽兵败，吴芮转投刘邦，被封为长沙王，迁都长沙。汉王四年（公元前209年），衡山郡恢复，郡城仍在邾城，属淮南国。不久，淮南国灭，但衡山郡仍存。
汉文帝十六年（公元前164年），迁皇室刘姓子孙自邾城，恢复衡山国，以邾城为都。汉元狩元年（公元前120年），衡山王刘赐阴谋反叛被杀，衡山国废，仍为衡山郡。次年，废衡山郡，划衡山、南郡14县置江夏郡，设邾县，以邾城为县城，属江夏郡。
东汉建安十二年（207年），邾长甘宁投奔孙权，邾县及邾城入吴。次年，吴分江夏郡置蕲春郡，邾县属吴蕲春郡。吴赤乌四年（241年），吴将陆逊夺取邾城，以重兵驻守，邾城长期为吴所有。
晋朝太康元年（280年），邾城归晋，邾县先后属晋之武昌郡、弋阳郡。永兴三年（306年），邾县属西阳国（王都在今河南光山县内）。
东晋咸康四年（338年），东晋在邾城侨置豫州。北周大象元年（579年）十一月，北周韦孝宽南下淮南，改罗州为蕲州，置永宁县（今武穴），属蕲州；改南司州为黄州（今黄陂地），置黄陂县，属黄州。
隋代开皇三年（583年），废原置西阳、齐安、梁安等郡，只设黄州，领南安、木兰两县。隋·开皇五年（公元585年），黄州移驻旧衡州（今麻城城内）。隋·开皇十八年（公元598年），朝廷推行州县制，改南安为黄冈，改廉城为麻城；改梁安为木兰。隋·大业三年（公元607年），朝廷改州县制为郡县制，将黄州改为永安郡，郡治移置举水之滨的黄冈县城（南安城今新洲县境内）。永安郡辖黄冈、黄陂、麻城、木兰4县。
唐朝武德三年（620年），永安郡废，恢复原黄州建置。次年，设黄州总管府，领黄冈、黄陂、麻城3县，省木兰入黄冈。唐·元和三年（808年），撤销麻城县，其地并入黄冈县。唐大中三年（849年），复置麻城县。黄州辖黄冈、黄陂、麻城3县。唐·中和五年（公元885年），黄州州城（黄冈县城）东迁60千米，在故邾城（今禹王城）遗址重建新城。
北宋初，黄州州城（黄冈县城）离开邾城遗址，向东南迁至江滨。黄冈县为望县，隶淮南路。宋熙宁五年（1072年）改隶淮南西路。
至元十四年（1277年）元立黄州路，领黄冈、麻城、黄陂3县，定为下路，黄冈县为中县。元·至正十一年（1351年）八月，徐寿辉率领农民起义军攻占黄州路。明·洪武元年（1368年），明王朝建立，改黄州路为黄州府。明·洪武十一年（1378年）撤蕲州，隶属黄州府，自此蕲黄合一，史称“蕲黄”。黄州府领一州七县，即蕲州、黄冈、麻城、黄陂、蕲水、罗田、广济、黄梅，隶湖广布政使司武昌道。明·嘉靖四十二年（1563年），朝廷诏令，割黄冈（中和乡）、麻城、黄陂3县地增置黄安县，黄州府领一州八县。
清·康熙三年（1664年），湖南、湖北分治，黄州府隶湖北布政使司汉黄德道。清·雍正七年（1729年），黄陂县划入汉阳府，黄州府领辖八属，即一州七县。
1912年2月，撤销黄州府，保留黄冈县建置。
1919年，民国政府设置黄冈县黄州区（又称第一区）。
1932年10月，属湖北省第四行政督察区专员公署（专署驻黄安）。
1936年，属湖北省第二行政督察区专员公署（专署暂驻蕲州，次年1月迁黄州）。
1940年，属湖北省政府鄂东行署，并在县治之地设置黄州镇，归属第一区管辖。
1945年11月，属湖北省第二行政督察区专员公署。
1949年黄冈县解放后，县治驻团风镇。属黄冈行政区督察专员公署，后改名为湖北省黄冈专员公署。
1951年6月20日，划出黄冈县西部徐古、汪集、李集、旧街、新洲、三店、仓埠、阳逻八区置新洲县。
1951年7月设立县级黄州镇（现黄州市区前身）属黄冈专署直辖。
1954年大水黄冈县县治毁坏，1955年县治由团风镇迁往黄州镇，黄州镇复归黄冈县。
1958年10月，撤销黄州镇，设立长江人民公社第七大队。同年12月，长江人民公社改称黄州人民公社。
1979年11月16日，鄂城市成立，划黄冈县黄州镇归鄂城市管辖。
1983年8月19日，黄冈县黄州镇划入江南鄂州市。
1984年1月正式移交，鄂州市在江北原黄州镇地域设置鄂州市黄州区。
1984年3月，黄州人民公社撤销，与堵城人民公社合并设立禹王城区。
1987年2月28日，国务院批准鄂州市黄州区撤销。原黄州镇地域划归黄冈县，仍为黄冈县直辖建制镇。
1990年12月26日，黄冈县改为黄州市。
1996年5月，经国务院批准，撤销黄冈地区建置，设立黄冈市；黄州市一分为二，分设为黄州区、团风县，隶属黄冈市人民政府。
