春秋属吴、越战国属楚、秦时为歙县辖地。
东汉建安十三年(公元208年),孙权遣威武中郎将贺齐击山越,分歙县东之叶乡置始新县,分歙县南之武强乡置新定县。此为淳安、遂安建县之始。
西晋太康元年(公元280年)改新定县为遂安县。
隋开皇九年(公元589年)改始新县为新安县,并遂安、寿昌县入新安县。仁寿三年(公元603年),遂安县从新安县分出复立。大业三年(公元607年)改新安县为雉山县。
唐文明元年(公元684年),复改雉山县为新安县。
开元二十年(公元732年)改新安县为还淳县,永贞元年(公元805年),避宪宗李纯名讳,改还淳为青溪县。
北宋宣和三年(公元1121年),改睦州为严州,咸淳元年(公元1265年)改为建德府,隶属未变。
元时,淳安、遂安属建德路;明、清属严州府。
民国元年(1912年)属浙江省;3年(1914年)属金华道;24年(1935年)属第五行政督察区。
1949年,淳安、遂安两县改隶第四行政督察区。
解放后,初属建德专署,1950年撤建德专署,改属金华专署。
1955年划归复设的建德专署。
1958年撤建德专属,淳安属金华专属。
1958年10月,淳安、遂安两县合并为淳安县。
1963年,淳安县划属杭州市。