周元王三年（前473），越灭吴，望亭属越国。
周显王三十五年（前334），楚灭越，望亭属楚国。
秦始皇二十六年（前221），始设吴县，望亭属会稽郡吴县余杭乡。
新莽始建国元年（9），改吴县为泰德县，望亭属泰德县。
西汉永建四年（129），析会稽郡钱塘江以西部分置吴郡，并恢复吴县，望亭属吴郡吴县。
三国吴（222—280），望亭属吴国（亦称东吴）。
西晋太康元年（280），西晋灭吴，望亭随吴县属西晋。
隋（581—617），望亭属吴州（吴郡）吴县。
唐万岁通天元年（696），析吴县东、北境置长洲县，与吴县合成而治。望亭属苏州府长洲县。
北宋大中祥符年间（1008—1016），望亭上塘属彭华乡，下塘属武邱乡。
明正德年间（1506年—1521年），上塘四都、五都属长洲县彭华乡（功成里），下塘六都属武邱乡（采云里），延续至清朝末年。
1912年，并长洲、元和两县和太湖、靖湖两厅入吴县，直隶于省，望亭复属吴县。望亭上塘仁巷港以南属浒关市金墅乡，上塘仁巷港以北及下塘属浒关市东桥乡。
1929年，望亭属吴县第四区（亦称望亭区），辖六镇三十三乡（详见本章第二节）。望亭区区公所驻望亭镇上塘街。
1934年，望亭属浒关区（第一区并入第四区，区公所驻浒关镇）。境内一镇四乡：望亭镇，镇公所驻望亭镇下塘街嘹望台；包殷乡，乡公所驻包兴镇；三民乡，乡公所驻诸葛庙；顾王乡，乡公所驻迎湖寺；华阳乡，乡公所驻猛将堂。
1941年，原第四区调整为第五区，区公所驻通安镇，望亭境内一镇（望亭镇）四乡（包殷乡、三民乡、顾王乡、华阳乡）属第五区。
1947年，并编区乡镇，望亭属浒关区，境内一镇一乡：望亭镇，镇公所驻望亭镇下塘街嘹望台；迎湖乡，乡公所驻迎湖寺。
1948年2月，并编乡镇，迎湖乡并入望亭镇，望亭镇为甲等镇，属浒关区。镇政府驻下塘问渡桥堍北侧。
1937年—1949年，中国共产党曾建立苏州县和锡东县民主政权，望亭大部分地区属苏州县亭太区，望亭为亭太区委所在地。望亭铁路以东属锡东县。
1949年4月24日，望亭解放。望亭镇仍属吴县浒关区。
1950年，重新划分区乡，望亭属浒关区。境内一镇三乡：望亭镇，镇政府驻望亭镇下塘模范街；望东乡（下塘原包殷乡），乡政府驻许家桥；望西乡（上塘原三民乡、顾王乡），乡政府驻迎湖寺；华巨乡（上塘原华阳乡），乡政府驻华阳庙。
1957年3月，吴县撤区并乡。望亭镇、望东乡、望西乡、新华乡（原华阳乡）合并为望亭乡，乡政府驻望亭镇人民街。
1958年，成立望亭人民公社，望亭人民公社属吴县。
1983年7月政社分设，成立望亭乡人民政府。
1985年7月13日，撤乡建镇，恢复望亭镇建置，改乡管村为镇管村。
公社、乡、镇政府驻地均在望亭镇人民街。
1995年2月8日，吴县撤县建市，望亭属苏州吴县市所辖。
2000年12月31日，经国务院批准撤销吴县市，分设苏州市吴中区和相城区，望亭镇属相城区管辖。
