公元前316年,秦灭蜀国设蜀郡,属蜀郡管辖。
汉武帝元鼎六年(公元前111年),汉武帝平定西南夷,以笮都为旄牛县置沈犁郡,郡治旄牛。
汉武帝天汉四年(公元前97年),撤沈犁郡入蜀郡。
东汉延光二年(123年),旄牛县治迁至今九襄镇。
东汉中平六年(189年),改蜀郡为汉嘉郡,旄牛县隶之。以后历代在此设郡、州、县等。
隋仁寿四年(604年),以汉源之名于今九襄镇置汉源县。
元、明为黎州安抚司。
清雍正七年(1729年),改称清溪县。
民国3年(1914年),因清溪县与贵州省的青溪县同名同音,复改名汉源县。
1950年3月,汉源解放,县城由清溪迁至九襄,属西康省雅安专区。
1952年10月,县政府驻地迁富林。
1955年10月,西康省并入四川省,汉源县属四川省雅安地区。
2000年12月,撤地设市,汉源县隶属四川省雅安市。
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