萨嘎,公元14世纪帕竹政权即在此设“萨嘎敦巴宗”。
西藏和平解放前萨嘎县称为萨嘎宗,属西藏嘎厦(地方)政府管辖,该宗设有东、西即僧俗两个宗本,由噶厦政府从哲蚌寺、色拉寺和大昭寺中直接选派任命。政权体制形式是“政教合一”的封建农奴制度。
1959年9月20日,成立中共萨嘎县临时委员会,1960年4月,成立了萨嘎县人民政府。
1960年5月,中共西藏工委决定,正式成立中共萨嘎县委员会。
1972年6月8日经西藏自治区革命委员会批准将县城迁至加加镇,于1974年10月14日正式搬迁。
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