公元前279年,楚将军庄蹻入滇。
公元前111年,设牂牁郡,华宁县属毋单县。
公元前109年,西汉兵临滇,滇王降,汉武帝赐滇王王印,并置益州郡,郡建置滇池县(今晋宁)、双柏县(今易门)、俞元县(今澄江)等24个县。
蜀汉时建置俞元县,隶属益州建宁郡。
晋、南北朝时期建置俞元县,隶属宁州建宁郡。
隋代建置西爨地,隶属宁州总管府。
唐代建置求州,隶属南宁州都督府;后南诏国建置温富州,隶属河阳郡。
宋代时为大理国所属,建置温富州休制部,隶属河阳郡。
元代建置温富千户所,辖部傍千户所、普舍千户所、研和千户所,隶属云南中路罗伽万户府;后设新兴州,辖休纳县、普舍县、研和县,隶属云南行中书省澄江路。
明代分属昆阳州、澄江府、临安府、宁州、元江府。
清承明制,分属云南府、澄江府、临安州、新兴州、元江直隶州等。
玉溪近代时期
民国元年,建置新兴县,隶属云南省。
民国二年,建置休纳县,隶属云南省。
民国五年,建置玉溪县,隶属云南省。
1916年,“玉溪”因横贯玉溪市区的珠江源头之一的玉溪大河(州大河)河水澄碧透亮,如玉带潺潺流淌在万亩田畴之中而得名,沿用至今。
玉溪解放后
1949年12月9日,卢汉率部起义,云南和平解放。
1949年12月18日,玉溪军事管制委员会成立,玉溪和平解放。
1950年1月1日,滇中区人民行政专员公署(同年3月改称玉溪行政专员公署)和玉溪县人民政府成立。
1950年10月,云南省人民政府正式成立。
1958年10月,玉溪、江川两县合并称玉溪县。
1961年10月,玉溪、江川两县仍分开。
1983年9月9日,玉溪县撤县建县级玉溪市。
1997年12月13日,撤玉溪地区建地级玉溪市,撤县级玉溪市建红塔区。
1998年,经国务院批准,撤销玉溪地区,设立地级玉溪市,6月28日,召开玉溪撤地设市庆祝大会,新设立的市级领导机关挂牌工作。玉溪市下辖红塔区(原县级玉溪市)、江川县、澄江县、通海县、华宁县、易门县、峨山彝族自治县、新平彝族傣族自治县、元江哈尼族彝族傣族自治县。
2006年末,玉溪市辖1个区,5个县,3个自治县;3个街道办事处,45个镇,17个乡,10个民族乡;50个居民委员会,617个村民委员会。
2015年12月3日,国务院(国函[2015]208号)批复同意撤销江川县,设立玉溪市江川区,以原江川县的行政区域为江川区的行政区域,江川区人民政府驻大街街道宁海路34号。