三国魏 ,西晋(220年--266年 )属兖州陈留郡(今开封)。东晋(317年)属豫州颍川郡(此年扶沟入新汲县,治所在汲乡,县城南迁改属颍川郡)。北魏(420年)属郑州部颍川郡(复置扶沟县),537年 属许昌郡。北齐,北周到隋( 550-581年) 属扬州部颍川郡(隋大业末年,新汲县废,并入扶沟。移县治于桐丘,今城北石桥)。
唐(621年)属北陈州,其年改属洧州(其年废除北陈州,改置洧州,州治在尉氏),627年属许州(贞观元年,废洧州)742年属颍川郡(许州改颍川郡),758年属许州。后梁后唐后晋后汉后周( 907年-951年)属东京开封府。宋(960年)属京畿开封府。金(1127年)属南京路开封府。元(1271年)属汴梁路总管府。明(1368年)属河南省开封府。清(1644年)属河南省开封府,1653年改属陈州府,1724年属直隶州,1734年复属陈州府。
至民国初,属河南开封道,民国十六年(1927年)改开封道为豫东行政区。
1947年,扶沟解放改属鄢陵建立的豫皖苏第五区,1949年归属淮阳专区,1953年改属许昌专区,1965年又设周口专区,扶沟归周口至今。