据《孝感县志》载，三汊港集镇（肖港镇）建镇已有300多年历史，至
已形成800多人居住的集镇。
“肖港”又称“肖家港”，其名来源于19世纪末，光绪二十五年（1899年），满清政府修建京汉铁路时，在此地建火车站。因附近有“白湖”和“三汊港”，且湖港周围有几个“萧”姓的大湾村，故取名“萧家港火车站”。光绪三十一年（1905年）前，原名肖家巷子，不足百名居民。京汉铁路建成后，逐渐发展成集镇。
肖港属于汉阳府孝感县。
民国时属孝感县第一区，民国十六年（1927年），生意人逐渐发展到400多人，且多数集中在铁路东侧交易，逐渐形成南北向的小集镇，当时称之为“湖港镇”。建国前后，“萧家港”设有区、乡政权机关，亦简称为“肖港”。
解放战争时期属肖港区，区公所设在杨桥村紫竹林。管辖24个乡、2个镇，即：高埠乡、金神乡、共和乡、肖港乡、曹庙乡、岳龙乡、仁和乡、东河乡、西河乡、余砦乡、凤凰乡、黑林乡、汪寺乡、陶庙乡、万安乡、胜利乡、赵寺乡、王店乡、刘店乡、兴安乡、里仁乡、陡岗乡、沙畈乡、刘光乡、三汊镇、陡岗镇。
1950年，区公所迁移至肖家港车站。
1951年，肖港区易名孝感县第十一区，同时将陡岗、胜利、朝阳等地划出，单独设立孝感县第十二区，十一区下辖15个乡镇。
1954年10月，孝感县第十二区（陡岗）和孝感县第十一区（肖港）合并，成立孝感县第十区，下辖高埠、金神、共和、肖港、曹庙、岳龙、仁和、东河、西河、余砦、凤凰、黑林、汪寺、陶庙、中分、段湖、袁畈、朝阳、万安、胜利、里仁、沙畈、刘光、涂河、陡岗镇、三汊镇。
1955年3月 ，孝感县第十区改名肖港区，为便于管理将所辖小乡合并成九个大乡，即肖港乡、东岳乡、杨河乡、梧桐乡、汪寺乡、五爱乡、胜利乡、陡岗乡、朝阳乡。
1958年，肖港区撤销，成立“肖港人民公社”，下设九个管理区，即梧桐、肖港、东岳、杨河、五爱、胜利、陡岗、朝阳、汪寺。
1961年，撤消肖港公社，恢复肖港区，原九个管理区改为九个小公社。即梧桐、肖港、东岳、杨河、五爱、胜利、陡岗、朝阳、汪寺。
1966年，朝阳被划入卧龙区，其他不变。
1971年，恢复肖港区委。
1975年2月，再次撤区并社，同时陡岗与肖港分家，原有的“小公社”并为肖港和陡岗两个“大公社”。肖港公社辖梧桐、肖港、东岳、杨河、杨林、五爱、汪寺七片；陡岗公社辖陡岗、卧龙区分出的朝阳、胜利三个片，“片”后又改名为“战区”、“管理区”。
1984年1月，再次并区建乡，肖港和陡岗两个大公社又合并成肖港区，下辖七个乡和两个镇：梧桐、东岳、杨河、杨林、五爱、汪寺、胜利七个乡和陡岗、肖港两个乡级镇（原朝阳管理区改为朝阳乡，划入卧龙区）。原大队和生产队改为行政村、组，有73个村民委员会、722个村民小组。
1987年9月，陡岗镇与肖港分家，陡岗、胜利和卧龙分出的朝阳合并设立陡岗镇。肖港镇只管辖原梧桐、肖港，东岳、杨河、杨林、五爱七个管理区。
1997年，为便于管理，经请示区政府批准，新设立仁和管理区、肖港办事处。自此肖港镇共管辖肖港、梧桐、东岳、杨河、仁和、杨林、五爱、汪寺八个管理区和一个办事处：即肖港办事处。
1999年，撤销管理区机构。
2009年初，肖港镇经请示区政府批准，把肖港村、白湖村、永久村、白马寺改为社区。
