清康熙九年(1670年)，沿袭明制，那楼大部分地区属于今灵山县管辖，全县编户为22里，领一坊16都；乾隆年间，编户仍为22里，划分一坊15乡，乡领17都22图，339个村落。于今那楼镇那务村大坡置西乡巡检司，西乡领上宁都图、中宁都图、下宁都图，46个村落。
嘉庆以后，沿用治安区域划分，县以下称为练。灵山县于今那楼镇、新江镇、百济镇一带设置上宁练、中宁练、下宁练。其中，下宁练练团置于那楼圩，辖81个村落。
民国元年至民国15年(1912～1926年)，灵山县仍沿用团练建制，全县共分18个练。今那楼镇大部分地区属于下宁练，北部地区属于中宁练。
民国16年(1927年)，开始废除团练建制，改设区乡，改制工作于民国20年结束。当时共设8个区，而区仅为区域划分，不设行政机构。
民国23年，石塘、镇安、化龙、中秀等4个乡从第二区分出，增设第九区。全县区辖60个乡。
第一区(附城) 辖东安、峰安、冠左、冠中、冠右、久治、仙山、仙岭、檀圩9个乡。
第二区(平山) 辖东中、永凝、永安、永吉、维灵、庆良、保良7个乡。
第三区（佛子）辖三圣、新化、芳兰、龙府4个乡。
第四区(平南) 辖平南、龙里、白花、烟悦、茅针、龙和、长福7个乡。
第五区(那隆) 辖正和、绥靖、钟灵、太平、那隆、三隆、龙山、申安8个乡。
第六区(旧州) 辖上安、中和、狮岭、沙坪、镇平、均安、南安、太平8个乡。
第七区(那楼) 辖百济、那楼、那路、光华、新江、那礼6个乡。
第八区(武利) 辖明山、联和、联卫、武利、维安、伯劳、升平7个乡。
第九区(石塘) 辖石塘、中秀、化龙、镇安4个乡。
民国24年(1935年)，灵山县废区并乡，成立保甲。
民国25年（1936年），那楼镇成立，与那楼乡并存，政府均设在那楼圩。
民国30年(1941年)10月1日，实施新县制，全县设立4个区，调整合并部分乡，调整后，4个区辖60个乡(镇)632个保6382个甲。那楼镇地区属于第四区。第四区辖7个乡65个保656个甲：均安乡7个保64个甲；那楼乡12个保129个甲；那凤乡10个保81个甲； 那路乡7个保74个甲；新江乡12个保111个甲；那礼乡6个保65个甲；百济乡11个保132个甲。区公所驻地那楼圩。（一说第四区辖6乡1镇：那楼乡、百济乡、新江乡、那礼乡、那路乡、光华乡和那楼镇）
民国36年(1947年)，全县划分为60个乡(镇)620个保6125个甲。今那楼片区大部分地区属于那楼乡，那楼乡辖11个保128个甲。
民国38年（1949年）7月，中国共产党在粤桂钦邕灵边区建立民主政府——粤桂边区钦邕灵人民政府在那楼圩成立，辖原灵山县那楼等7个乡镇、邕宁县蒲津等4各乡镇及原钦县南荣乡。
那楼镇解放后
1950年初，邕宁、灵山解放，那楼乡人民政府成立。同年，成立灵山县那楼区人民政府。
1950年1月10日，上级又将原属灵山县暂时划给钦县（今钦州）管辖的灵西特区，包括那楼乡、那路乡、光华乡、新江乡、那礼乡、百济乡和华灵乡划归灵山县管辖，并取消特区名称，改名为灵山县第七区。
1951年6月2日又将第七区即那楼区划给邕宁县管辖。同年，邕宁县行政区划作调整，排序如下：一区驻蒲庙，二区驻四塘，三区驻八塘，四区驻伶俐，五区驻刘圩，六区驻那楼，七区驻新江，八区驻百济，九区驻那陈，十区驻苏圩，十一区驻那马，十二区驻吴圩，十三区驻老口，十四区驻心圩，十五区驻坛洛，十六区驻那龙。
1958年2月，撤区并乡，成立五塘、那楼、老口、吴圩、南阳、伶俐6个办事处；同月，又改为5个办事处，即蒲庙、那楼、五塘、吴圩、老口，并将全县244个小乡并为59个大乡。同年5月，改置后那楼办事处所辖乡及高级社如下（以下简称“社”）；那楼（14社）、汉林（10社）、南阳（22社）刘圩（12社）、中山（22社）、红星（13社）、中和（12社）、河浪（10社）、百济（10社）、方村（11社）、镇龙（16社）、屯林（8社）、那里（6社）。同年8月，实现人民公社化，撤销办事处，成立那楼人民公社。9月，又改为跃进人民公社，辖原那楼乡、镇龙乡。
1984年又复那楼乡。
1987年，那楼乡分设镇龙乡。
1994年8月，那楼乡改为那楼镇，那楼镇人民政府成立。2005年3月18日，那楼镇划属邕宁区，辖1个社区居委会15个村委会。同年6月15日，撤销镇龙乡建置，整体并入那楼镇。镇政府管辖那楼、镇龙两个社区，坛墩、屯六、坛垌、那盆、中山、罗马、屯了、那文、那头、那旺、三江、那务、那利、河浪、华佳、屯良、那他、棠梨、那丰、那良20个村委会，有97个自然坡（屯），719个村民小组。
