东汉建武年间(25~56),改名为章安县。其辖区相当于今温州四县、台州四县及处州、松阳等地。吴太平二年(257)于章安置临海郡,辖章安、临海、始平、永宁、松阳(安阳)、罗阳(安固)、罗江县,相当于今浙东南和闽北的大部。
隋开皇九年(589) 废临海郡,置临海县。
明洪武二十年(1387)筑城设卫,以御倭寇,始称海门卫。
清顺治十一年(1654),移定海镇驻海门,在此前后,设临海县丞衙门于海门。十八年(1661)清廷颁布禁海令,沿海居民内迁,海门设台寨驻兵,仅留少数居民。康熙二十二年(1683)开海禁,复置。道光二十三年(1843),移台州同知衙门于葭沚,以加强对沿海的统治。光绪二十年(1894)开埠通商,发展成为商埠。
1928年建临海县海门区。
1934年,浙江省第七行政督察专员公署设海门。
1941年4月因日军窜扰而迁临海。
1949年6月海门解放后,建为台州专员公署直属海门区。
1958年10月,海门、洪家两区合并建立海门人民公社。下辖7个大队(管理区)和1个渔业专业大队。
1960年初,原洪家区划出, 5月,大陈镇从海门划出。
1961年6月,撤销海门人民公社,恢复海门区公所,下辖4个人民公社。
1969年改为海门区革命委员会,1979年5月撤销区革命委员会,恢复区公所。
1980年7月由黄岩县分出,建立海门特区,1981年7月经国务院批准成立椒江市,为浙江省第一个县级市。
1994年设台州市于椒江,遂撤椒江市,为台州市椒江区。
2001年11月,撤洪家、东山、三甲、下陈、章安、前所6镇,设为洪家街道、三甲街道、下陈街道、章安街道、前所街道,原东山镇并入葭沚街道、撤黄礁乡,并入章安街道。
2003年,椒江区下辖海门街道、白云街道、葭沚街道、洪家街道、下陈街道、三甲街道、章安街道、前所街道、大陈镇、椒江海洋渔业总公司、椒江农场。