民国元年(1912),裁县存府,次年裁府复县,隶辰沅道。
民国11年,废辰沅道,芷江直隶于省。
民国24年,属芷黔麻晃行政督察区。
民国25年,属湖南省第四行政督区,次年属省第七行政督察区,民国29年属省第十行政督察区。
1949年10月2日,中国人民解放军第28军112师解放芷江。10月26日,成立芷江县人民政府,先后隶属会专区、芷江专区、黔阳专区、黔阳地区。
1955年5月1晶,县人民政府改称县人民委员会,1968年9月8日,成立县革命委员会,行使县人民政府职权。
1980年12月4日,重新建立县人民政府。
1981年因黔阳地区改称怀化地区,芷江随隶之。
1986年9月22日,国务院批准,撤销芷江县设立芷江侗族自治县,隶属与管辖区域不变。
1998年,怀化撤地设市,芷江侗族自治县隶属怀化市。
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