民国1年，成立县公署。2年（1913年）划分南区设靖边行政区。文山县地域西南抵干鱼洞接许六马以那么果河为界110公里，总面积6258平方公里。
民国10年9月，文山县已全部组成。
民国18年（1929）年，公布《县组织法》。19年改组县公署为县政府，组织区、乡、镇、闾、邻各级自治机关。21年划东区设砚山设治局，文山县辖区2935公里。全县改组为8个区，下辖11镇、21个乡。
民国26年（1937年），为动员全面抗战，根据立法院通过的《保甲条例》，全县将区、乡、镇所属编为216保、1922甲。
民国28年废除区制，扩大乡镇，县新编组为5镇、11乡、194保、1866甲。
民国32年（1943年），全县16乡镇调整为155保、1272甲。
民国37年，又调整为134保、1061甲。
1950年1月全县解放，辖区未变。除县城两镇并为云威镇，太集（改永乐）、新平两乡直属县管外设平坝、马塘、秉烈、德厚4个区，辖3镇11乡。5月撤乡镇设5个区，全县编组为50个行政村、5个行政街，下辖自然村和村组。
1951年10月，将中心区农村7个行政村及平坝区的布都、塘子寨2 个行政村并为攀枝花区，县城设城关区，全县共6个区。
1952年土改结束，全县6个区建97个乡。
1953年土改复查结束并为74个乡、3个居民委员会。
1954年除城关区外，再调整为81个乡，全县共760个自然村、21条街组。
1957年5月，文山专区以文山县的鸣鹫、杨柳河、猛拉、舍所坝、秧草塘、白牛厂、老寨、古布龙等8个乡距县城较远，划入蒙自专区蒙自县。文山县总面积减为2634平方公里。全县6个区、73个乡和3个居民委员会。
1958年9月，废区撤乡，实行政社合一的人民公社。马关县的古木、八寨两个区划出12个乡并入文山县，总面积扩大到6844.55平方公里。
1961年8月，恢复砚山县制，文山县总面积减为2867平方公里。
1987年12月，进行区乡体制改革，变区为16个乡（其中：5个彝族乡、1个回族乡）、1个镇，撤销公社建制。原设乡改为125个行政村公所，县属开化镇仍设5个办事处。全县辖1097个自然村，13个农村街集，47条城镇街道，共1707个生产队。拉白冲、拖嘎两个乡划归砚山县，文山县总面积减为2972平方公里，自此稳定未变。
1991年全县生产队改制为农业全作社。
1993年全县乡镇、行政村、办事处未变，下辖1116个自然村，1481个合作社。2000年8月全县设9镇、8个乡，125个村民委员会，5个居民委员会，1088个自然村，1531个合作社（生产队）。
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