隋开皇(581-600年)初废六同郡,直属戎州。
隋仁寿初年(601-604年)因避太子杨广讳,改为南溪县。县初治今宜宾市翠屏区李庄镇北岸(涪溪口至桂轮场)。隋大业初年(604-617年),属犍为郡。
唐乾符二年(875年),在仙源坝筑奋戎城(今南溪镇)。
唐武德元年(618年),属戎州。
唐天宝元年(742年),属南溪郡。
唐乾元元年(758年),复属戎州。
宋乾德(963-969年)中,迁治奋戎城。南溪建县前,隶属犍为郡僰道县。梁时属戎州六同郡。
宋乾道六年(1170年),属叙州。
元至元十八年(1281年),隶于叙州路。
明清时,属叙州府。
1913年,废叙州府,隶于川南道分巡。
1914年,隶于永宁道分巡。
1929年撤永宁道,直属四川省。
1935年至1949年,属第六行政督察区专员公署。
1949年12月7日南溪县解放,1950年,南溪县属宜宾专区专员公署。
1954年,属宜宾专员公署。
1978年-1997年,属宜宾地区行政公署。
1997年撤地设市以来,隶属宜宾市管辖。
2011年,省人民政府同意撤销南溪县,设立宜宾市南溪区。