清为正红旗、正黄旗的北部。
民国年间归绥远省。
1949年并入绥东四旗中心旗。
1954年将正红旗、正黄旗、陶林县、集宁县各析一部分置察哈尔右翼后旗。
1955年2月,将锡林郭勒盟苏尼特右旗新民区划归察哈尔右翼后旗,1956年1月,又将新民区和土牧尔台区东方乡的苏合少、刘家沟两村划归苏尼特右旗。
1957年11月,将集宁县大西沟、大六号、贲红、高茂、曹不汗、高玉梁、黄羊城划归察哈尔右翼后旗。
1958年6月,将四子王旗所属海青花、三井泉、大西村、土城、明乐划归察哈尔右翼后旗。
1958年3月,撤区划乡,将32个乡镇划为22个乡镇,同年10月把22个乡镇划为6个人民公社、1个镇公社。
1962年5月,将6个人民公社调整为19个人民公社。
1967年,改称察哈尔右翼后旗革命委员会。
1971年,旗人民政府从土牧尔台迁往白音察干。
1981年6月,察哈尔右翼后旗革命委员会改称察哈尔右翼后旗人民政府。
1984年4月,人民公社改为乡镇(苏木)人民政府,时辖21个乡(苏木)镇。
1997年,察哈尔右翼后旗辖20个乡(苏木)镇。
2000年,察哈尔右翼后旗辖2个镇、3个苏木、15个乡。
2003年,察哈尔右翼后旗辖5个镇、4个乡、5个苏木。
2006年,辖7个苏木、乡、镇,85个嘎查、行政村。
2012年,恢复大六号镇。调整后,察哈尔右翼后旗辖5个镇、2个苏木、1个乡:白音察干镇、土牧尔台镇、红格尔图镇、贲红镇、大六号镇、当郎忽洞苏木、乌兰哈达苏木、锡勒乡。