1. t4连接酶作用原理
这个在书上有介绍的吧。
DNA连接酶也叫DNA的合成酶。我以前读中学的时候叫DNA合成酶,上了大学就叫DNA连接酶。
来源于大肠杆菌,可用于连接粘性末端;T4DNA连接酶,来源于T4噬菌体,可用于连接粘性末端和平末端,但连接效率低。
2. t4连接酶温度
T4噬菌体被证明是一个解决基因和信息传递本质的理想体系,是生命科学研究的一种模式生物。
T4 DNA连接酶
科学家们在T4噬菌体中发现了一种酶,称为T4 DNA连接酶。T4 DNA连接酶这种连接酶是由噬菌体T4基因编码的,感染大肠杆菌后,在宿主细胞中产生。其相对分子质量为6800,既可催化DNA黏性末端连接,也可催化平末端连接。T4 DNA连接酶在基因工程操作中被广在基因工程操作中被广泛应用
3. t4dna连接酶作用原理
DNA连接酶分为两类:常用的E·coliDNA连接酶(大肠杆菌中分离)和T4DNA 连接酶(T4噬菌体中分离的)
4. T4连接酶
合成酶(synthetase)又称为连接酶(ligase),DNA连接酶属于合成酶,DNA聚合酶不是合成酶,DNA聚合酶是多功能酶。真核生物里常见的连接酶(合成酶)有DNA连接酶Ⅰ。DNA连接酶II,DNA连接酶III。原核生物里常见的有T4连接酶。
RNA聚合酶是在转录的时候,以核苷酸为原料,DNA的一条链为模板,合成RNA的酶RNA连接酶是可以识别特定RNA序列,将两端RNA链接起来的酶
5. t4连接酶连接体系比例
合成酶(synthetase)又称为连接酶(ligase),DNA连接酶属于合成酶,DNA聚合酶不是合成酶,DNA聚合酶是多功能酶。真核生物里常见的连接酶(合成酶)有DNA连接酶Ⅰ。DNA连接酶II,DNA连接酶III。原核生物里常见的有T4连接酶。
合成酶类(ligase)催化两分子底物合成为一分子化合物,同时偶联有ATP的磷酸键断裂释能的酶类。例如,谷氨酰胺合成酶、DNA连接酶、氨基酸:tRNA连接酶以及依赖生物素的羧化酶等。
6. T4DNA连接酶的作用机制
基因克隆的基本步骤流程如下:
一、目的DNA片段的获得:
DNA克隆的第一步是获得包含目的基因在内的一群DNA分子,这些DNA分子或来自于目的生物基因组DNA或来自目的细胞mRNA逆转录合成的双链 cDNA分子。
由于基因组DNA较大,不利于克隆,因此有必要将其处理成适合克隆的DNA小片段,常用的方法有机械切割和核酸限制性内切酶消化。若是基因序列已知而且比较小就可用人工化学直接合成。如果基因的两端部分序列已知,根据已知序列设计引物,从基因组DNA 或cDNA中通过PCR技术可以获得目的基因。
二、载体的选择:
基因克隆常用的载体有:质粒载体、噬菌体载体、柯斯质粒载体、单链DNA噬菌体载体、噬粒载体及酵母人工染色体等。从总体上讲,根据载体的使用目的,载体可以分为克隆载体、表达载体、测序载体、穿梭载体等。
三、体外重组:
体外重组即体外将目的片断和载体分子连接的过程。大多数核酸限制性内切酶能够切割DNA分子形成有黏性末端,用同一种酶或同尾酶切割适当载体的多克隆位点便可获得相同的黏性末端,黏性末端彼此退火,通过T4 DNA连接酶的作用便可形成重组体,此为黏末端连接。
当目的DNA片断为平端,可以直接与带有平端载体相连,此为平末端连接,但连接效率比黏端相连差些。有时为了不同的克隆目的,如将平端DNA分子插入到带有黏末端的表达载体实现表达时,则要将平端DNA分子通过一些修饰;
如同聚物加尾,加衔接物或人工接头,PCR法引入酶切位点等,可以获得相应的黏末端,然后进行连接,此为修饰黏末端连接。
四、导入受体细胞:
载体DNA分子上具有能被原核宿主细胞识别的复制起始位点,因此可以在原核细胞如大肠杆菌中复制,重组载体中的目的基因随同载体一起被扩增,最终获得大量同一的重组DNA分子。
五、重组子的筛选:
从不同的重组DNA分子获得的转化子中鉴定出含有目的基因的转化子即阳性克隆的过程就是筛选。发展起来的成熟筛选方法如下:
(1)插入失活法:外源DNA片段插入到位于筛选标记基因(抗生素基因或β-半乳糖苷酶基因)的多克隆位点后,会造成标记基因失活,表现出转化子相应的抗生素抗性消失或转化子颜色改变,通过这些可以初步鉴定出转化子是重组子或非重组子。常用的是β-半乳糖苷酶显色法即蓝白筛选法(白色菌落是重组质粒)。
(2)PCR筛选和限制酶酶切法:提取转化子中的重组DNA分子作模板,根据目的基因已知的两端序列设计特异引物,通过PCR技术筛选阳性克隆。PCR法筛选出的阳性克隆,用限制性内切酶酶切法进一步鉴定插入片段的大小。
(3)核酸分子杂交法:制备目的基因特异的核酸探针,通过核酸分子杂交法从众多的转化子中筛选目的克隆。目的基因特异的核酸探针可以是已获得的部分目的基因片段,或目的基因表达蛋白的部分序列反推得到的一群寡聚核苷酸,或其它物种的同源基因。
(4)免疫学筛选法:获得目的基因表达的蛋白抗体,就可以采用免疫学筛选法获得目的基因克隆。这些抗体即可是从生物本身纯化出目的基因表达蛋白抗体,也可从目的基因部分ORF片段克隆在表达载体中获得表达蛋白的抗体。
扩展资料:
基因克隆的注意事项:
1、平端连接:DNA连接酶可催化相同和不同限制性核酸内切酶切割的平端之间的连接。原则上讲,限制酶切割DNA后产生的平端也属配伍末端,可彼此相互连接;若产生的粘性末端经特殊酶处理,使单链突出处被补齐或削平,变为平端,也可实行平端连接。
2、加尾连接:同聚物加尾连接是利用同聚物序列,如多聚A与多聚T之间的退火作用完成连接。在末端转移酶作用下,在DNA片段端制造出粘性末端,而后进行粘性末端连接。这是一种人工提高连接效率的方法,也属于粘性末端连接的一种特殊形式。
3、人工接头连接:对平端DNA片段或载体DNA,可在连接前将磷酸化的接头(linker)或适当分子连到平端,使产生新的限制性内切酶位点。再用识别新位点的限制性内切酶切除接头的远端,产生粘性末端。
7. T4连接酶连接体系
T4 DNA Ligase即T4 DNA连接酶,可以催化粘端或平端双链DNA或RNA的5’-P末端和3’-OH末端之间以磷酸二酯键结合,该催化反应需ATP作为辅助因子。
同时T4 DNA连接酶可以修补双链DNA、双链RNA或DNA/RNA杂合物上的单链缺刻(single-strand nicks)。
8. t4酶的作用
T4 DNA聚合酶由于同时具有5'→3'DNA聚合酶活性和3'→5'DNA外切酶活性,可以用于将5'端突出末端补平或3'端突出末端削平。T4 DNA聚合酶的3'→5'DNA外切酶活性对于单链DNA要比双链DNA活性更高,即单链DNA要比双链DNA中的非配对链部分更容易被T4 DNA聚合酶所消化。T4 DNA聚合酶的3'→5'外切酶活性比Klenow Fragment要高约200倍。产品用途:T4 DNA Polymerase可用于催化以下反应:DNA 5'或3'突出末端的平滑化;通过置换反应进行标记DNA探针合成;定点突变过程中第二链的合成;不依赖于连接反应的PCR产物克隆。