三国时期为魏地,隶属同汉。
西晋属济北国;东晋改国为郡,东阿属之。
南北朝时期,因南北分裂,政权迭易,457年东阿并入谷城县。
后魏,恢复东阿县。
北齐省谷城,入东阿,属济州。
隋朝,东阿属兖州济北郡。
621年(唐武德四年),属济
州,隶河南道。
742年(天宝元年)更州为郡,隶济阳郡,同年恢复谷城县。
754年改属郓州东平郡。
766年(大历元年),郓州改为淄青道,东阿属之;819年,郓州属天平郡,东阿随之改隶。
五代十国时期,东阿属郓州天平节度使。
宋初,属京东路;1041年(庆历元年)置西路安抚使,东阿随郡改隶;1115年郡升为大都督府,1127年改为东平府,东阿均属之。金代,隶山东西路东平府。
元初,隶东平路。1272年,东平改为下路总管府,司六县,东阿属之。
明初属于东平府,1375年(洪武八年)隶济宁府东平州,1385年改属兖州,隶山东布政使司。
清初,属兖州府东平州;1735年(雍正十三年)改属泰安府。
1912年(民国元年),东阿隶山东东临道。
1932年,东阿与阳谷邻界的部分村庄作了调整。
1928年废道直隶山东省府。
1936年隶山东省第六督察专员公署。
1940年县人民政权建立后,隶鲁西行署运东专署(第四专署)。
1941年7月,鲁西行署和冀鲁豫行署合并,成立冀鲁豫行署,下辖7个专署,东阿隶第四专署。
1942年12月,冀鲁豫行署一、四专署合并为一专署,东阿属之。
1945年8月,日军投降后,隶冀鲁豫行署第六专署。
1949年8月,隶平原省聊城行政督察专员公署。
1952年11月平原省撤消,东阿随聊城专署该隶山东省。
1958年12月,东阿建制撤消,各公社分别并入寿长、茌平两县。
1961年7月恢复东阿县,其隶属未变。
1967年专区改为地区,东阿属山东省聊城地区行政公署。