1996年，面积118.5平方千米，人口2.4万人，辖柳家、下方泉、西姜、水亭坞、水亭街、周邵汤、下蒋、上吴、上朱、范坞、殿下、黄村坞、垂江、陈塘下、盖竹里、杨田坞、尚方、松树下、塘上、古塘、芳茗叶、午塘池、河伯沿、柳塘章、奎塘畈、奎塘、生塘胡、生塘徐等37个行政村。
2005年末，面积48.3平方千米，人口2.29万人，辖水亭街、周邵汤、水亭塘、西姜、下方泉、陈塘下、尚方、垂江、下蒋、上吴、黄村坞、杨田坞、松树下、盖竹里、芳茗叶、塘上、古塘、午塘边、午塘桥、河伯沿、珠带式、杨宝塘下、横塘、上周、施家、范坞、殿下、西方坞、丁家、上朱、柳家、生塘胡、生塘徐、白鹤桥、柳塘章、奎塘畈、奎塘37个行政村。2007年11月6日，浙政函[2007]158号批复同意将水亭畲族乡生塘徐村划归游埠镇管辖；调整后，水亭畲族乡辖36个行政村，乡政府驻地不变（水亭街村）。
【邮编】321107【2011年代码及城乡分类】330781203:～200 220柳家村 ～201 220下方泉村 ～202 220西姜村 ～203 220周邵汤村 ～204 210水亭街村 ～205 210水亭坞村 ～206 210下蒋村 ～207 220上吴村 ～208 220上朱村 ～209 220殿下村 ～210 220范坞村 ～211 220垂江村 ～212 220黄村 ～213 220陈塘下村 ～214 220盖竹里村 ～215 220杨田坞村 ～216 220尚方村 ～217 220松树下村 ～218 220塘上村 ～219 220芳茗叶村 ～220 220古塘村 ～221 220午塘村 ～222 220午塘桥村 ～223 220河伯沿村 ～224 220杨宝塘村 ～225 220上周村 ～226 220横塘村 ～227 220施家村 ～228 220珠带式村 ～229 220白鹤桥村 ～230 220丁家村 ～231 220西方坞村 ～232 220柳塘章村 ～233 220生塘胡村 ～235 220奎塘村 ～236 220奎塘畈村
自2015年12月21日启动行政村规模调整工作以来，到2016年1月17日，全市201个新村全部挂牌成立。本次调整后，水亭畲族乡辖水亭村、殿下村、金印村、古塘村、午塘新村、黄江村、横塘村、奎塘畈村、珠带式村、河伯村柳家村、下方泉村、西姜村、周邵汤村、上朱村、丁家村、柳塘章村、生塘胡村、西方坞村等19个行政村。
