2000年，清镇市辖4个镇、6个乡。 根据第五次人口普查数据：总人口471305人，其中各乡镇人口（人）： 红枫湖镇 152920 站街镇 77945 卫城镇 51595 新店镇 44611 王庄布依族苗族乡 17322 麦格苗族布依族乡 19239 暗流乡 17558 王庄布依族苗族乡 17975 流长苗族乡 40547 犁倭乡 31593 。
2001年，清镇市辖6个乡（其中3个民族乡），4个镇、299个村委会、43个居委会。年末总人口50.53万人，其中少数民族人口11.92万人，占23.59%。非农业人口10.85万人。
2002年9月5日，贵州省人民政府批准，调整清镇市红枫湖镇行政区划，设立青龙街道。将红枫湖镇所辖的中心、青龙、东北等20个村及新华路、建国路、新民路等19个居委会辖区划由青龙街道管辖，红枫湖镇所辖行政区域相应进行调整。
2002年，全市辖4个镇、6个乡（其中3个民族乡），299个村委会、43个居委会。年末总人口为50.96万人。其中，非农业人口10.98万人，少数民族人口10.84万人。
2003年，全市辖1个街道、4个镇、6个乡（其中3个民族乡），299个村委会、32个社区。年末总人口51.65万人，其中非农业人口11.08万人，占21.46%。
2006年3月27日，《省人民政府关于同意清镇市调整站街镇红枫湖镇部分行政区划的批复》（黔府函[2006]36号）同意清镇市调整站街镇和红枫镇部分行政区划，将原属站街镇的骆家桥村划归红枫湖镇管辖。
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