一类含有同源框的基因。在胚胎发育中的表达水平对于组织和器官的形成具有重要的调控作用。该类基因的突变，会在胚胎发育过程中导致某一器官异位生长，即本来应该形成的正常结构被其他器官取代了。例如，果蝇的同源异型基因Antp（触角基因）的突变，导致果蝇的一对触角被两?b腿所取代。同源异型基因中有一段高度保守的DNA序列称为同源异型框，最初是通过对果蝇的同源异型突变和体节突变体的杂交分析发现的，简称同源框。同源框由180个碱基对组成的序列，可编码60个氨基酸。这60个氢基酸序列,被称为同源异型结构域。同源框普遍存在于果蝇、鼠、人、蛙等生物中。已发现的Hox基因的产物基本上都是转录因子，同源框的蛋白产物呈螺旋-转角-螺旋的立体构型，可以和DNA双螺旋的主沟吻合，附着于邻近于TAAT的碱基，由于它能识别所控制的基因启动子的特异序列，从而在转录水平调控基因表达。同源异型基因的突变称为同源异型突变。这种突变可致使身体某一部位的性状特征在其他部位出现，并有可能干扰机体各部分的正常发育。Hox基因大多在染色体上串联排列成簇、基因之间的距离很近，通常为4-5kb,其线性排列顺序可能与各自表达区域相对应，例如在果蝇发育中，位于DNA5’端的Hox基因在接近其尾部的节段中表达，而位于3’端的Hox基因在接近头部节段中表达。Hox基因的表达具有区域特异性(特别在胚胎发育阶段)。例如果蝇触须足基因和超级双胸基因只限于在头部和胸部的节段中表达，其表达量与发育的进程有关；
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