秦朝，为月氏地。
汉初，被匈奴所据；汉武帝时建河西四郡，至西晋时分属武威郡和金城郡；东晋十六国时分属武威、昌松、广武3郡。
隋代，为凉州武威郡所辖。
唐朝，属陇右道凉州武威郡。
五代时，属凉州，由吐蕃折逋氏家族统治。
北宋，属西凉府；公元1036年后为西夏属地。
元代，设永昌路，分属西凉州和庄浪县。
明朝，设陕西行都司，先后属庄浪卫、凉州卫和古浪守御千户所。
清代，属凉州府，由武威、平番、古浪3县辖之；乾隆十八年（1753）设庄浪茶马理番同知，管辖3县所属的今天祝藏族部落。
民国，初属甘凉道，由平番县辖；民国三年（1914）裁庄浪茶马同知，设庄浪茶马厅理番委员，由平番县长兼任；民国十六年（1927）改平番县为永登县；民国二十五年（1936）取境内天堂、祝贡二寺之首字为名设天祝乡，属永登县；民国二十七年（1938）天祝乡改为永登县第四区；民国二十九年（1940）复设天祝乡；民国三十三年（1944）废庄浪茶马厅。
1949年9月3日，永登县解放，同年成立永登县天祝区；1950年5月6日成立天祝自治区（县级），属武威专区；1953年10月22日改称天祝藏族自治区，1955年7月19日，更名为天祝藏族自治县，属武威专区；1955年10月，撤销武威、酒泉两专区，其辖区并入张掖专区，天祝藏族自治县属张掖专区；1958年12月，撤销古浪县建置，其辖区并入天祝县；1961年11月，恢复武威专区，天祝县划归武威专区管辖；1961年12月，恢复古浪县原建置。
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