秦汉时汉人移入,设青衣县,属蜀郡。
唐宋之际,称羁縻州地,隶属雅州都督府。
元末始称董卜,开始引入喇嘛教,青衣羌人转公为蕃民,隶属吐蕃宣慰司,土酋统治并归附朝廷。
清朝乾隆年间更名为穆坪。
民国十七年(1928年)土改归流,民国十九年(1930年)建县。因当地矿产丰富,取《礼记·中庸》“今夫山,一卷石之多及其广大,草木生云,禽兽居之,宝藏兴焉”之意而命名为宝兴。
民国二十四年(1935年),中国工农红军长征经过宝兴,于十月建立宝兴苏维埃政权。
民国二十八年(1939年),西康建省,宝兴隶属西康省第2行政督察区直至解放。
1950年5月15日,宝兴解放。
1952年中华人民共和国中央人民政府撤销川东、川西、川南、川北行署区,恢复四川省建制。
1951年,第2行政督察区改称雅安专署,宝兴属雅安专署。
1955年,撤销西康省,金沙江以东划归四川省,宝兴属四川省雅安专署。
1981年,雅安专署改称雅安地区,宝兴属雅安地区。2000年,雅安撤地设市,宝兴隶属雅安市。