1997年8月29日撤销邵阳市东区、西区、郊区,调整设立邵阳市双清区、大祥区、北塔区。双清区辖原东区的龙须塘、汽车站、小江湖、火车站、桥头、东风路6个街道和原郊区的火车站、高崇山、城东、石桥、云水、鸡笼6个乡,区人民政府驻建设路。因名胜“双清秋月”而得名。10月,正式挂牌成立。
2000年,双清区辖6个街道、2个镇、4个乡。
2002年,双清区辖6个街道办事处、4乡、2镇,70个居委会、73个村。总面积139.6平方千米,其中城区面积27平方千米,农村面积112.6平方千米。
2004年,双清区辖6个街道、2个镇、4个乡。
2015年,双清区辖1乡2镇6街道。
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