1、第1集：一九三八年的古城西安随着西安事变的发生，这座十三朝古都倍受瞩目。八路军高级参议宣侠父在西安城里公开演讲，向众人宣传救国救民的主张。宣侠父倍受学生和群众拥戴，他激昂的演讲吸引了大批拥簇，甚至把西安城的主干道堵得水泄不通。几辆车子被人群堵在了外面，车上坐着的人全是国民党的军政要员。
2、第2集：武仲明出任破反专员，军统的徐亦觉和刘天章两个人心里最不痛快，徐亦觉性格直率，将自己的不满挂在嘴上，而刘天章则将自己的不痛快埋在心里，而且武仲明毕竟是自己曾经的上级。不过让人庆幸的是，虽然二人都对武仲明不服气，可是因为军统和中统向来不合，因此也没有联手的可能。
3、第3集：沈兰正式到了军统机要科工作，她的出现让石孟很不满，因为沈兰的出现让本来就不受重视的石孟甚至在机要科没有了位置，可是沈兰不在乎这些，一直在监听那个日本电台信号的去向。心情郁闷的石孟又去找武仲明诉苦，听到石孟说沈兰在监测日本电台信号，武仲明立刻闯进了机要科，从沈兰手里接过耳机进行搜查日本电台的信号。
4、第4集：徐亦觉将那些可疑人员抓回去后准备审讯，他准备叫人去请武仲明，但被亲信丁股长给阻拦了，丁股长怕武仲明抢了徐亦觉的功劳，徐亦觉听信了丁股长，就没有让人把武仲明请来。武仲明从师应山的言行举止中得知他们警察局在蓝田的烟土案中吃回扣，可是在那个兵荒马乱的年代，这种情况太普遍，武仲明也只是睁一只眼闭一只眼。
5、第5集：罗子春回来，武仲明特意把从前的老部下叫到一起聚会，也算是为他接风。刘天章和石孟应邀前来，几人叙旧之时，蒋宝珍竟然过来插一脚，还要拜武仲明为师，武仲明对其一直是敬而远之，因此并没有答应，他还向蒋宝珍推荐了刘天章，可是蒋宝珍根本看不上刘天章。蒋宝珍也是个聪明的女孩，从刘天章的举止上她便能看出刘天章是个极度虚伪的人，刘天章见蒋宝珍甚至能读懂自己的心思，更是吓出了一身冷汗。蒋宝珍则饶有兴趣的跟刘天章提出了和他做笔交易。
6、第6集就在武仲明整个脑子都在案情上时，他没想到他最信任的罗子春竟然把自己平时吃的药给换了。同时，刘天章一直都在调查武仲明，甚至还抓了武仲明在日本留学时的同学进行审问，而刘天章的调查得到了蒋敬文的授意。王经理的死让武仲明非常愤怒，他怒斥徐亦觉为了自己的私欲滥杀无辜，搅乱调查方案，因为武仲明已经调查清楚这个王经理并不是汉奸。徐亦觉被臭骂一顿，心里也不好受。
7、第7集：蒋宝珍在刘天章那里得知武仲明竟然在调查自己，这让她心里很不舒服。武仲明向老魏表示想要离蒋家人远一些，他担心蒋宝珍是蒋敬文的一步棋子。沈兰从武仲明那里听说武伯英牺牲的消息，沈兰一直不相信武伯英叛变，于是请求上级进行调查，给她一个真相。上级考虑到沈兰的情绪，准备安排沈兰带着她的孩子回延安。而就在这时候，却有陌生身影盯住了他们。
8、第8集：八办找到武仲明，要他出赎金，营救的事情由八办自己组织。师应山觉得这是件好事，只要能赶紧把案子结了就好，但是武仲明并不这么认为。蒋宝珍为武仲明的反复无常而非常生气，蒋敬文对蒋宝珍十分宠爱，不停地开导她，劝她不要再对武仲明付出感情了，可是蒋宝珍却不答应。
9、《密查》是由徐兵监制，泳群编剧，王兵执导，郑凯、邓莎领衔主演，于荣光、连奕名、常铖、亓航、曲翊宏、张博涵等主演的年代谍战剧，该剧改编自马营的小说《密查1938》，讲述了在国共合作的关键时期，共党高级将领宣侠父离奇失踪，为了调查真相，武仲明介入调查的故事。
