平潭全区辖7镇8乡：潭城镇、苏澳镇、流水镇、澳前镇、北厝镇、平原镇、敖东镇、白青乡、屿头乡、大练乡、芦洋乡、中楼乡、东庠乡、岚城乡、南海乡。居委会、行政村共计200个。区政府驻潭城镇新区。
平潭县
秦始皇二十六年(前211年)，平潭属闽中郡。
西汉高祖五年(前202年)属闽越国；武帝元鼎五年(前112年)，属会稽郡南部都尉。
东汉建安八年(203年)，属会稽郡侯官都尉。
三国吴景帝永安三年(260年)，属会稽南部建安郡侯官县。
晋太康三年(282年)，属扬州刺史晋安郡原丰县。元康元年(291年)晋安郡原丰县改隶于江州刺史。
南朝明帝泰始四年(468年)，晋安郡改名晋平郡，齐建元二年(480年)复名，仍隶江州。梁武帝普通六年(525年)，属东扬州晋安郡原丰县。陈永定元年(557年)增置闽州，属闽州原丰县；天嘉六年(565年)取消闽州，仍属东扬州晋安郡原丰县；光大二年(568年)改晋安郡为丰州，平潭属丰州原丰县。
隋开皇九年(589年)改丰州为泉州(今福州)，平潭属泉州原丰县；大业二年(606年)泉州改称闽州；大业三年(607年)，废闽州，改置建安郡(郡治闽县，即今福州)，平潭属建安郡闽县。
唐开创道、州、县三级制。武德元年(618年)，改建安郡为建州，平潭属建州闽县。武德六年(623年)，建州复称泉州，隶岭南道，析闽县置新宁，闽县为州驻地。武德八年(625年)置泉州都督府，改新宁县为长乐县，平潭属泉州长乐县。
唐圣历二年(699年)，析长乐县南8乡置万安县，平潭属泉州(今福州)万安县；景云二年(711年)，泉州复名闽州，设闽州都督府，万安属闽州；开元十三年(725年)，改闽州为福州都督府(福州名由此始，此后泉州名即指今泉州)隶属江南东道；天宝元年(742年)改福州为长乐郡，万安县更名福唐县，平潭属江南道长乐郡福唐县。
五代梁太祖开平二年(908年)，福唐县改名永昌县，后唐同光元年(923年)，复名福唐县，均属福州；闽龙启元年(933年)，福州改称长乐府，改福唐县为福清县。天德二年(944年)闽王王延政据建州建殷国，后改闽国，以福州为东都，平潭属东都福清县。后汉乾祐元年(948年)，福州改称福州威武军。后周广顺元年(951年)，改福州威武军为彰武军，平潭属福州彰武军福清县。
宋朝改唐代的道、州、县制为路、州、县制。北宋太平兴国三年(978年)，福州彰武军复称福州威武军，属两浙西南路。雍熙二年(985年)置福建路，领12县，平潭属福清县。南宋景炎元年(1276年)升福州为福安府，定为行都，平潭属福安府福清县。
元朝，中央设中书省，地方设行中书省，领路、州、县。至元十五年(1278年)改福安府为福州路，属福建行中书省。元贞二年(1296年)升福清县为福清州，平潭属福建行中书省福州路福清州。
明初承袭元制，改路为府。洪武元年(1368年)福州路改福州府。洪武二年(1369年)，福清州复为福清县，平潭属福清县。
清承明制，雍正八年(1730年)，福清县丞移设于平潭。以海坛岛及周围屿头岛、小练岛、大练岛、小庠岛、东庠岛、牛山岛、吉钓岛、草屿、塘屿析归平潭县丞管辖。嘉庆三年(1798年)二月二十七日，析原平潭县丞管辖区域海坛岛及周围9岛置平潭海防厅，直属福州府。
中华民国实行省县二级制。
民国元年(1912年)10月14日，废厅置平潭县，仍属福州府。
民国2年废府置道，平潭属东路道。
民国3年东路道改名闽海道。
民国16年道废，平潭直属省辖。
民国22年11月“福建事变”，在福州成立中华共和国人民革命政府，福建划分4省，平潭属闽海省。“福建事变”失败后，民国23年7月，国民政府将福建省划分10个行政督察区，平潭属第一行政督察区；民国36～38年平潭改由省政府直辖。
民国38年5月6日，平潭人民游击支队攻克平潭县城，13日成立平潭县人民政府，属中国共产党闽中工作委员会领导。
民国38年7月3日至9月15日，国民党73军和74军军部及其51师以及天九部队占据平潭。
民国38年9月16日，平潭解放。9月23日，再次成立平潭县人民政府，属福建省人民政府第四行政专员公署管辖。
1949年10月1日，中华人民共和国成立后，平潭仍属第四专署。
1950年4月专署改称闽侯专员公署。
1956年6月，闽侯专区撤销，平潭属晋江专区。同年7月21日，经国务院批准，将大扁岛(面积4.8平方公里)划归福清县辖。
1959年8月，恢复闽侯专区，平潭属闽侯专区。
1971年6月，闽侯专区革命委员会改称莆田地区革命委员会，平潭属莆田地区革委会。
1983年6月，平潭划归福州市人民政府管辖。
1995年，仍属福州市人民政府。
