公元前17世纪以前，被称为“非洲之角”的索马里建立
了以产香料著称的“邦特”国。
公元7世纪起，阿拉伯人逐渐移居此地，伊斯兰教也随之普及。在亚丁湾和印度洋沿岸建立贸易点和若干个苏丹国。
13世纪时曾建立过封建帝国。
1417年至1419年，郑和率领的中国明朝政府海上舰队在他第五次下西洋中，访问了索马里海滨的几个城邦，其中包括木骨都束（摩加迪沙）。
1960年6月26日，北部地区独立。
1960年7月1日，南部地区独立，同日南、北两部分合并，成立索马里共和国。
1969年10月，改称索马里民主共和国，1991年2月改现名。
从1840年开始，英、意、法殖民主义者相继侵入和瓜分索马里。
1887年北部沦为英国保护地，称英属索马里。1885年意大利开始入侵中部，至1925年整个中、南部沦为意大利殖民地，称意属索马里。
1941年，英国控制了整个索马里。
第二次世界大战后，1949年联合国决议将原意大利侵占区交意大利托管。
1960年，英、意先后被迫同意英属索马里和意属索马里独立（1960年6月26日索马里北区独立，7月1日索马里南区独立），两地在同年7月1日合并成立索马里共和国。
1969年，索马里国民军司令穆罕默德·西亚德·巴雷发动政变上台，成
立索马里民主共和国。
1976年7月成立“索马里革命社会主义党”并接管最高革命委员会的全部权力，同月西亚德任总统。
1991年1月西亚德政权被推翻，索马里陷入内战，多个政权并存。
1991年2月，阿里·迈赫迪·穆罕默德成立新政府，自命为“临时总统”，改国名“索马里共和国”。
1991年5月18日，索马里北部宣布独立，成立“索马里兰共和国，阿卜杜拉赫曼·艾哈迈德·阿里·图尔为“总统”，1993年5月，穆罕默德·易卜拉欣·埃加勒继任“总统”。
2002年4月，埃加勒病逝后，原“副总统”达希尔·里亚尔·卡辛于5月1日继任“代总统”。
2012年9月10日，哈桑·谢赫·马哈茂德当选索马里总统。
