“指纹”（fingerprint）作为鉴定起源于19世纪末20世纪初犯罪学和法医学。人的指纹由于生物学上的原因，存在个体的差异。这种差异表现在人身上，体现为指纹具有唯一性的特点，即每个人的指纹（三种基本模式，拱形、环形、和螺纹形）是不一样的，是有特征的。这种特征并不随时间环境的变化而改变，因此，广泛应用于罪犯的识别，特殊证件的制作等。 分子生物学告诉我们，人的基因存在共性，即不同生物种群有其特定的DNA组成，同时个体之间存在差异，这种差异在本质上表现为基因的不同，即DNA组成序列的差异。目前DNA分析技术的日益成熟，用DNA鉴别来判断不同人之间的血缘关系应用已十分广泛，如亲子鉴定，尸体身份鉴别，生物种类判别等。其本质的判别同指纹完全一致，不过由于DNA数目的巨大，相同基因序列数目远比不同基因序列的数目大的多，而且作为生物基本组成的基因，由于其稳定性不可能性有很大的差异。因此其判别选择的对象十分重要，应选择特定的变异性相对较大的DNA片断分析，作为特征性的指纹图谱，实际上是在某个点上判别，这个点的判断不影响整体性。在应用于中药的指纹图谱方面，DNA可以作为种属的鉴别，不同植物之间存在的差异性相对较大，鉴别真假较容易，但动物药相对较难，矿物药则不行。其次，可应用于同种植物间，也就是对不同生物隔离的相同类型植物的鉴别，即产地。不过这二种鉴别是对生物学属性的鉴别，虽不受外界过多的干扰，但植物药的次级代谢产物（多为药用部分），更易受环境的影响，二者之间存在不确定因素。因此，我认为DNA作为指纹图谱可应用于种类的鉴别，但植物类别多，研究不够深入。研发成本非常高，在实际的应用方面有相当的距离。不过从长远看，保护我国中药资源，建立基因库，则有其特殊的作用。
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