痢疾杆菌是革兰氏染色阴性的兼性菌，不具动力。在普通培养基中生长良好，最适宜的温度为37℃，不耐热及干燥，阳光直射即有杀灭作用，加热60℃10分钟即死亡；但耐寒能力强，在阴暗潮湿及冰冻环境下能生存数周，在蔬菜、瓜果、腌菜中能生存1～2周。对一般消毒剂如新洁尔灭、来苏、过氧乙酸等抵抗力弱，可被迅速杀死。 根据生化反应与抗原结构的不同，分为4群。甲群为志贺氏菌群，有10个血清型；乙群为福氏菌群，有13个血清型；丙群为鲍氏菌群，有15个血清型；丁型为宋内氏菌群，仅有1个血清型。各群痢疾杆菌在菌体裂解时均释放出内毒素，但产生外毒素的能力各种群差异很大，其中以志贺氏痢疾杆菌产生外毒素的能力最强，故临床症状较为严重。
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