溶组织内阿米巴包囊随宿主粪便排出体外，随被四核包囊污染的食物或饮水而进入人体，在人体小肠中，在胰蛋白酶的作用下四核滋养体脱囊而出，随肠蠕动进入大肠，并在下移过程中分裂为4个小滋养体，定居于结肠粘膜皱褶或肠腺窝处，以摄取细菌及食物残渣为生，进行二分裂繁殖。部分小滋养体，由于肠内环境改变，小滋养体逐渐团缩，形成包囊混于宿主粪便排出，故溶组织内阿米巴生活史的基本过程是包囊-小滋养体-包囊。 当宿主机体抵抗力降低、肠功能紊乱以及肠壁受损时，小滋养体可侵入肠壁组织中，吞噬红细胞和组织细胞，转变为组织型大滋养体，并大量繁殖，不断破坏和溶解肠壁组织，形成肠壁溃疡。部分大滋养体可随溃疡组织落入肠腔，随宿主粪便排出。在肠壁内的大滋养体有时可随血流至肝、肺、脑等部位寄生繁殖。大滋养体不能直接形成包囊，当离开肠壁组织落入肠腔，则可转变为小滋养体。大、小滋养体随人粪排出后迅速死亡。包囊对外界环境有较强的抵抗力，存活时间较长。
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