为了便于将上市公司与标的企业的价值进行有效衡量，双方的财务报表一般需要预先进行如下调整：第一：双方必须使用相同的会计方法，例如库存方法统一使用先进先出法或者后进后出法；第二：双方需要调整那些非经营性或非持续性项目，以便得到最能准确反映企业经营业绩的财务报表。
接下来需要比较双方的财务指标，例如毛利率、资产使用率、资产收益率、资产流动性等等，然后根据这些定性或定量的因素判断标的公司是否达到了被参照公司的水平。通过各项指标的逐一对比，如果标的企业的指标高于被参照公司，那么说明标的企业拥有比被参照公司更大的优势，可以相应增加价值乘数；如果标的企业的指标与被参照公司基本相当，那么说明标的企业与被参照公司的优势大致相当，双方价值基本持平；如果标的企业的指标低于被参照公司，那么说明标的企业没有拥有被参照公司一样的优势，因此应该相应减少价值乘数。
另外，增长率是提高价值乘数的重要因素。需要仔细查看双方企业在收入和利润等方面的历史增长与预期增长，认真研究导致增长的因素，判断双方企业今后的增长潜力，然后以被参照公司的增长状况为基准，确定标的公司增长率方面的价值乘数。
综合上述分析的结果，可以为标的企业选择一个较为合理的乘数。这个乘数应该能够反映驱动企业价值的因素和风险，以及标的公司相对于被参照公司的优势或劣势。并且最后得出的结论应该与对市场及行业的分析、对影响价值的竞争因素及风险因素的分析结论相一致。
在进行企业价值对比时，标的企业与被参照公司的财务报表时期应该大致相同。如果财务报表属于不同的时间段，那么就需要仔细考虑时间变化带来的影响，尤其是对循环经营或季节性较强的行业的影响。在有些情况下，时期即使仅相差一个季度，财务状况也可能造成显著的不同。
以下是企业并购估值中最常用的乘数计算和对比方法：
普通股价格÷税后利润——这个乘数适用于大部分盈利的公司。
普通股价格÷收入——这个乘数适用于同质性强的行业，可以合理预期产生较一致的收入或现金流。
普通股价格÷（净利润＋折旧＋摊销）——分母使用总现金流而没有使用净现金流是由于估计上市公司的净现金流一般很困难。
普通股价格÷股东权益——这个乘数常用于银行业的并购估值。
(股权价值＋债务)÷（息、税、折旧、摊销前收益）——这个乘数经常应用在所有并购估值中。
使用上市公司基准法的最大益处在于：它提供了充分分析行业内公司的机会，并明确了这些公司的价值驱动因素和风险因素是什么。在分析过程中通常能够洞察到一些企业创造优势或促进发展所采取的战略措施，以及造成劣势或阻碍发展的问题所在。
