（1）目标与成分不同：特膳是为特殊人群提供特殊营养的，即提供特殊的生理和营养成分(无法从日常的普通膳食中摄取)；保健食品向人们提供的则是能调节人体机能的特定生理成分；普通食品向人们提供的是人体所需的基本营养物质。
(2)食用价值不同：①营养价值：特膳有丰富而具特殊指向性的营养成分；普通食品不同程度地有某些基本营养成分；保健食品不能以提供营养成分为主要目的，更不能提供特殊营养。②生理功能价值：保健食品具有明确的指向性的生理功能价值，因而其对应的生理功能成分往往是最强化的；特膳食品虽然往往有较丰富而具特殊指向性的生理成分，但一般来说其单一指向性的生理功能，成分的强化程度不如保健食品；普通食品不以提供生理功能价值为主要目的。③生物利用价值：特膳食品具有高水准以及安全的生物利用价值，即代谢负担低，生物指标也很严格(指细菌、农残或重金属指标)，没有毒副作用；保健食品代谢负担相对最高，有一定的毒副作用(因此虽然不是药，仍然要谨遵医嘱)，生物指标则很严格；普通食品有一定程度的代谢负担、生物指标也较宽松、一般没有毒副作用。
(3)配方与工艺不同：特膳在配方及工艺上具有明确的针对性或指向性，系统的定量性和广泛的多样性，因而和其他所有的食品形式相比，具有最大的特殊性和复杂性。
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