玉米丝黑穗病与高粱丝黑穗病病菌是同一个种的两个不同生理型。玉米上的菌系不能侵染高粱，高粱丝黑穗病菌虽能侵染玉米，但侵染力极低。玉米丝黑穗病菌主要为害玉米的雄穗（天花）和雌穗（果穗），一旦发病，通常全株没有产量。 为害轻的雄穗呈淡褐色，分枝少，无花粉，重则全部或部分被破坏，外面包有白膜，形状粗大，白膜破裂后，露出结团的黑粉，不易飞散。小花全部变成黑粉，少数尚残存颖壳，有的颖壳增生成小叶状长4-5厘米。 病果穗较短，基部膨大，端部尖而向外弯曲，多不抽花丝，苞叶早枯黄向一侧开裂，内部除穗轴外，全部分变成黑粉，初期外有灰白膜，后期白膜，后期白膜破裂，露出结块的黑粉，干燥时黑粉散落，仅留丝状残存物。受害较轻的雌穗，可保持灌浆前的粒形，但籽粒压破后仍为黑粉，也有少数仅中、上部被破坏，基部籽粒呈3-5厘米长的芽状物或畸形成成丛生的小叶物，内含少量黑粉。 此外，早期病株多表现为全身症状，植株发育不良，表现矮化、节间缩短；叶片丛生，色暗绿，稍窄小伸展不匀，生有黄白色条班；茎弯曲，基部稍粗，分蘖增多，重则甚至早死。多数病株，前期不表现症状，植株较正常株矮1/3-2/5,果穗以上部分显著细弱。有的病株前期没有异常表现，但抽穗迟。 玉米丝黑穗病的病原菌为孢堆黑粉，属担子菌亚门孢堆黑粉属，病组织中散出的黑粉为冬孢子，冬孢子黄褐色至暗紫色，球形或近球形，直径9～14 μm，表面有细刺。冬孢子在成熟前常集合成孢子球并由菌丝组成的薄膜所包围，成熟后分散。冬孢子萌发温度范围为25～30℃，适温约为25℃，低于17℃或高32.5℃不能萌发；缺氧时不易萌发。病菌发育温度范围为23～36℃，最适温度为28℃。冬孢子萌发最适pH 4.0～6.0，中性或偏酸性环境利于冬孢子萌发，但偏碱性环境抑制萌发。丝黑粉菌有明显的生理分化现象。侵染玉米的丝黑粉菌不能侵染高粱；侵染高粱的丝黑粉菌虽能侵染玉米，但侵染力很低，这是两个不同的专化型。丝黑穗病菌属担子菌纲，黑粉菌目，黑粉菌科、轴黑粉病属。 此菌厚垣孢子圆形或近圆形，黄褐色至紫褐色 ，表面有刺。孢子群中混有不孕细胞。厚垣孢子萌发产生分隔的担子，侧生担孢子，担孢子可芽殖产生次生担孢子。厚垣孢子萌发适温是27-31摄氏度，低于17摄氏度，或高于32.5摄示度不能萌发。厚垣孢子从孢子堆中散落后，不能立即萌发，必须经过秋、冬，春长时间的感温的过程，使其后熟，方可萌发。
